Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHMP3Q9Y3E7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP3Q9Y3E7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms