Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A0

COQ4, Ubiquinone biosynthesis protein COQ4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ4Q9Y3A0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COQ4Q9Y3A0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COQ4Q9Y3A0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms