Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GIT1Q9Y2X7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GIT1Q9Y2X7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GIT1Q9Y2X7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GIT1Q9Y2X7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIT1Q9Y2X7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GIT1Q9Y2X7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIT1Q9Y2X7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIT1Q9Y2X7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GIT1Q9Y2X7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GIT1Q9Y2X7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIT1Q9Y2X7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GIT1Q9Y2X7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GIT1Q9Y2X7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIT1Q9Y2X7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GIT1Q9Y2X7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GIT1Q9Y2X7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GIT1Q9Y2X7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GIT1Q9Y2X7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GIT1Q9Y2X7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms