Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP1Q9UPQ3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGAP1Q9UPQ3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms