Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRQQ9UMZ3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRQQ9UMZ3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRQQ9UMZ3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRQQ9UMZ3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRQQ9UMZ3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRQQ9UMZ3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRQQ9UMZ3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRQQ9UMZ3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRQQ9UMZ3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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