Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PADI3Q9ULW8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PADI3Q9ULW8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PADI3Q9ULW8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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