Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PNMA8BQ9ULN7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA8BQ9ULN7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA8BQ9ULN7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA8BQ9ULN7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA8BQ9ULN7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA8BQ9ULN7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA8BQ9ULN7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA8BQ9ULN7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA8BQ9ULN7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA8BQ9ULN7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA8BQ9ULN7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA8BQ9ULN7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA8BQ9ULN7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA8BQ9ULN7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA8BQ9ULN7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA8BQ9ULN7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PNMA8BQ9ULN7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA8BQ9ULN7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA8BQ9ULN7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA8BQ9ULN7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA8BQ9ULN7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA8BQ9ULN7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA8BQ9ULN7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PNMA8BQ9ULN7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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