Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRID1Q9ULK0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRID1Q9ULK0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms