Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA11Q9UKX5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA11Q9UKX5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms