Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC9Q9UKV0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC9Q9UKV0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC9Q9UKV0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms