Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIX4Q9UIU6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIX4Q9UIU6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms