Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VTI1BQ9UEU0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VTI1BQ9UEU0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms