Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NKX1-2Q9UD57 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NKX1-2Q9UD57 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms