Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP35Q9P2H5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP35Q9P2H5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP35Q9P2H5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms