Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP36Q9P275 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms