Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HCN3Q9P1Z3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms