Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR4Q9NYA4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR4Q9NYA4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR4Q9NYA4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms