Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM248Q9NWD8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM248Q9NWD8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms