Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATG3Q9NT62 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATG3Q9NT62 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATG3Q9NT62 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms