Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms