Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOMER2Q9NSB8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOMER2Q9NSB8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOMER2Q9NSB8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms