Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNFRSF19Q9NS68 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms