Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LTBP3Q9NS15 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
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