Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNNM1Q9NRU3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNNM1Q9NRU3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms