Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPRD1BQ9NQG5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPRD1BQ9NQG5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms