Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPHS2Q9NP85 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPHS2Q9NP85 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms