Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BPIFA1Q9NP55 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA1Q9NP55 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms