Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SUDS3Q9H7L9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SUDS3Q9H7L9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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