Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLSTN2Q9H4D0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLSTN2Q9H4D0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms