Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX5Q9H2C1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX5Q9H2C1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms