Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC90BQ9GZT6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms