Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFIH1Q9BYX4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms