Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GSDMCQ9BYG8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms