Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NIFKQ9BYG3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NIFKQ9BYG3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms