Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC31.1■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC31.08■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
HIRIP3Q9BW71 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
HIRIP3Q9BW71 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms