Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK3

MXRA8, Matrix remodeling-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA8Q9BRK3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MXRA8Q9BRK3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
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