Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR46

C20orf78, Putative uncharacterized protein C20orf78, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf78Q9BR46 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C20orf78Q9BR46 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms