Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRQ99707 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRQ99707 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRQ99707 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRQ99707 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRQ99707 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRQ99707 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRQ99707 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRQ99707 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRQ99707 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRQ99707 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRQ99707 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRQ99707 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRQ99707 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRQ99707 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRQ99707 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRQ99707 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTRQ99707 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTRQ99707 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTRQ99707 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MTRQ99707 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MTRQ99707 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTRQ99707 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTRQ99707 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTRQ99707 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTRQ99707 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTRQ99707 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTRQ99707 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRQ99707 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRQ99707 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRQ99707 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRQ99707 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRQ99707 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRQ99707 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRQ99707 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRQ99707 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRQ99707 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRQ99707 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRQ99707 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRQ99707 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRQ99707 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRQ99707 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRQ99707 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRQ99707 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRQ99707 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRQ99707 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRQ99707 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTRQ99707 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTRQ99707 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTRQ99707 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTRQ99707 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTRQ99707 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTRQ99707 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTRQ99707 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTRQ99707 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MTRQ99707 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTRQ99707 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTRQ99707 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTRQ99707 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTRQ99707 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTRQ99707 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTRQ99707 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTRQ99707 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTRQ99707 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTRQ99707 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTRQ99707 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTRQ99707 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTRQ99707 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTRQ99707 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTRQ99707 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTRQ99707 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTRQ99707 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTRQ99707 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTRQ99707 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTRQ99707 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTRQ99707 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTRQ99707 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTRQ99707 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTRQ99707 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTRQ99707 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTRQ99707 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRQ99707 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRQ99707 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRQ99707 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRQ99707 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRQ99707 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRQ99707 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRQ99707 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRQ99707 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRQ99707 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRQ99707 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRQ99707 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRQ99707 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRQ99707 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRQ99707 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTRQ99707 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTRQ99707 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTRQ99707 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTRQ99707 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTRQ99707 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms