Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK5RAP2Q96SN8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK5RAP2Q96SN8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms