Protein–RNA interactions for Protein: Q96SM3

CPXM1, Probable carboxypeptidase X1, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPXM1Q96SM3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPXM1Q96SM3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPXM1Q96SM3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms