Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPS6KC1Q96S38 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS6KC1Q96S38 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms