Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARXQ96QS3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARXQ96QS3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARXQ96QS3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms