Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP4

TSGA13, Testis-specific gene 13 protein, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSGA13Q96PP4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSGA13Q96PP4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSGA13Q96PP4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSGA13Q96PP4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSGA13Q96PP4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSGA13Q96PP4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSGA13Q96PP4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSGA13Q96PP4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSGA13Q96PP4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSGA13Q96PP4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSGA13Q96PP4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSGA13Q96PP4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSGA13Q96PP4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSGA13Q96PP4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSGA13Q96PP4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSGA13Q96PP4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TSGA13Q96PP4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSGA13Q96PP4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSGA13Q96PP4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSGA13Q96PP4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSGA13Q96PP4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSGA13Q96PP4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSGA13Q96PP4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TSGA13Q96PP4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSGA13Q96PP4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSGA13Q96PP4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSGA13Q96PP4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSGA13Q96PP4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSGA13Q96PP4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSGA13Q96PP4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSGA13Q96PP4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSGA13Q96PP4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSGA13Q96PP4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms