Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC43Q96MW1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC43Q96MW1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms