Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C8orf48Q96LL4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8orf48Q96LL4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms