Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM47Q96LD4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM47Q96LD4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms