Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms