Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
USP47Q96K76 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP47Q96K76 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms