Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGBD1Q96JS3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGBD1Q96JS3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms