Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 AL355478.1-201ENST00000431686 821 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MS4A3Q96HJ5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MS4A3Q96HJ5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MS4A3Q96HJ5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MS4A3Q96HJ5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MS4A3Q96HJ5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A3Q96HJ5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A3Q96HJ5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A3Q96HJ5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A3Q96HJ5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A3Q96HJ5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A3Q96HJ5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A3Q96HJ5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A3Q96HJ5 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A3Q96HJ5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A3Q96HJ5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MS4A3Q96HJ5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms